Приказом МЗ РФ №342 от 14 июня 2018 г. ФГБУ «НМИЦ ССХ им. А.Н. Бакулева» Минздрава России внесен в 1-ю категорию научных «Организаций-лидеров». Научные организации относят к той или иной категории согласно Правилам, утвержденным Постановлением Правительства РФ №312 от 8 апреля 2009 года.