Приказом директора ФГБУ «НЦССХ им. А.Н. Бакулева» МЗ РФ, академика РАН Л.А. Бокерия №126 во исполнение Распоряжения Правительства РФ от 13.03.2015 г. №421-р, предусматривающего передачу Центра в ведение МЗ РФ, а также в связи с приказом МЗ РФ от 01.07.2015 г. №398 о внесении изменения в действующий Устав Центра установлено новое наименование Центра: ФГБУ «НЦССХ им. А.Н. Бакулева» МЗ РФ.